Nature Communications:科学家开发了一种高通量鉴定和量化菌群中单个细菌的新技术 |
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资料来源:科技部生物中心,2022-04-03 17336000
科学家们开发了一种新技术,用于高通量识别和量化菌群中的单个细菌。
细菌以菌群的形式广泛存在于地球中。了解菌群中细菌的组成和数量,对于研究菌群的功能以及菌群如何影响宿主的体内平衡是非常重要的。然而,目前很难在单个细菌的水平上测定菌群组成。最近,日本科学家开发了一种高通量鉴定和量化菌群中单个细菌的新技术。该研究成果发表在《Nature Communications》期刊上,题目是《微生物群中单个细菌细胞的高通量鉴定和量化》。
这项技术被命名为Barbiq(Barcoding Bacteria for identificati on and quantization),它基于16S rRNA基因测序和单细胞标记技术,将单个细菌细胞识别为分类群,以高通量的方式对每个分类群进行定量,并达到单碱基的准确性。研究人员将该技术应用于小鼠肠道微生物区系的研究,从小鼠粪便中鉴定并量化了810个分类群的3.4105个细菌细胞,发现了饮食维生素A缺乏小鼠肠道微生物区系的轻微变化。
BarBIQ可以精确可视化整个菌群和单个细菌,具有高通量的优势,为广泛研究菌群提供了新的工具。
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