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Nat Commun:将风险毒素变为生物感触感染器

2019年11月1日 讯 /100医药网BIOON/ --某些类型的细菌具有给其他细胞“打孔“并杀逝世它们的才能。他们经过释放被称为“成孔毒素”(PFT)的特别卵白质来完成此目标,该卵白质锚定在细胞膜上并构成”管状”通道,并最终招致细胞的“自我扑灭”。除已知的“沾染”细胞的才能外,PFT在其它方面的潜力也惹起了人们的极年夜兴味。例如,它们构成的纳米级孔可以用于“感测”DNA或RNA等生物分子。 DNA或RNA像被电压所掌握的绳索一样穿过纳米孔,其单个构成成分(例如DNA中的核酸)经过时可收回共同电旌旗灯号,进而被读取。实践上,纳米孔感测曾经成为市场上DNA或RNA测序的次要对象。比来,来自EPFL的Matteo Dal Peraro引导的迷信家在《Nature Communications》上揭橥的文章研讨了另一种次要的PFT——“aerolysin”, 由嗜水气单胞菌细菌发生。该PFT或答应以用于更庞杂的传感任务,例如卵白质测序。

(图片起源:Www.pixabay.com)

aerolysin的次要长处之一是它构成的孔十分狭隘,是以具有比其他毒素高得多的分辩率。但是,先前的研讨固然曾经发明了aerolysin可用于“感知”生物分子,但简直没有关于aerolysin的构造与其分子感测才能之间关系的研讨。在这一研讨中,研讨人员起首应用aerolysin的构造模子经过盘算机模仿研讨其构造。该模子协助迷信家们懂得分歧氨基酸分子若何影响aerolysin的功效。一旦懂得了这种关系,研讨人员便开端战略性地改动盘算机模子中的分歧氨基酸构成。然后猜测每种变更对aerolysin的全体功效的影响。经过这种办法,研讨人员找到了aerolysin的构造与功效之间关系的身分:aerolysin的帽状构造。溶血素的孔不只包含一个穿过膜的管,并且还具有帽状构造,该区域的静电力可以吸引并约束目的分子。Dal Peraro说:“经过懂得溶菌素孔的构造若何与其功效接洽的细节,我们如今可以设计出用于各类传感使用的定制孔状构造。这将为DNA测序,卵白质测序及其翻译后润饰的生物分子的检测开拓新的的机遇,并无望使用于基因测序和诊断用生物标记物检测中。(100医药网100yiyao.com)

资讯出处:

原始出处:Chan Cao, Nuria Cirauqui, Maria Jose Marcaida, Buglakova Elena, Alice Duperrex, Aleksandra Radenovic, Matteo Dal Peraro. Nature Communications, 2019 DOI: 10.1038/s41467-019-12690-9

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