高粱驯化改良过程中基因组印记的分子植物:分析 |
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来源:植物研究所,2022年1月11日08:00
作物的驯化和遗传改良在从游牧狩猎向定居生活方式的转变中发挥着关键作用。高粱是一种具有多种用途的谷类作物,如食品、饲料、酿酒、制糖和生物燃料生产。面对可持续发展的需要和气候环境的挑战,揭示高粱驯化改良过程中的基因组选择,探索种间杂交和平行/趋同进化的遗传机制,具有十分重要的意义。根据种质资源驯化改良阶段,中国科学院植物研究所景海春课题组
作物的驯化和遗传改良在从游牧狩猎向定居生活方式的转变中发挥着关键作用。高粱是一种具有多种用途的谷类作物,如食品、饲料、酿酒、制糖和生物燃料生产。面对可持续发展的需要和气候环境的挑战,揭示高粱驯化改良过程中的基因组选择,探索种间杂交和平行/趋同进化的机制,具有十分重要的意义。
中国科学院植物研究所景海春课题组根据种质资源驯化改良阶段和育种利用情况,对全球445份高粱种质资源进行了群体分析。研究发现,不同亚组的亲缘关系相对独立,但存在明显的混淆,亚组间存在广泛的基因流动,表明高粱种内和种间杂交频繁。研究还表明,在几个亚组中有大片段的相似染色体连锁块,这也可以作为每组中频繁基因流动的证据。
通过正向选择扫描分析,研究者发现高粱基因组中有14.68%(~107.5 Mb)在进化过程中被选择,涉及驯化阶段、粒用高粱改良和甜高粱改良3,649、4,287和3,888个基因。总结出从野生种到地方种再到高粱改良的驯化基因过程中,存在8种不同的单倍型变化模式。Sh1和SbTB1基因分别代表了两种重要的模式,即弱选择和多起源模式、强选择和单一驯化模式。此外,该研究还证明了高粱茎秆汁液含量的关键调控因子——转录因子Dry基因在粒用高粱改良过程中的无意识选择。该研究为揭示高粱的驯化过程和改良高粱奠定了分子基础。
相关研究成果在线发表在《分子植物》上。该研究得到了国家重点研发项目的支持;d计划和中国科学院战略试点科技项目。(100yiyao.com)
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