Nat Med：全基因组测序有助于个别化癌症医治

2019年10月1日 讯 /生物谷BIOON/ --一项揭橥在《Nature Medicine》杂志上的研讨标明，对肿瘤细胞的全基因组测序可以协助猜测患者的癌症预后，并为肯定最无效的医治办法供给线索。我们的基因组由一串称为核苷酸的分子构成。这些由字母A，C，G和T表现。有时，DNA的“拼写”产生变更，例如A酿成G。这些变更被称为渐变。渐变能够是由多种身分惹起的，包含自觉与情况搅扰，例如裸露于烟草烟雾或紫外线下，而且都在基因组上留下了特点。

（图片起源：Www.pixabay.com）当细胞决裂时，它们会复制其DNA，是以任何“拼写”毛病都邑被复制。跟着工夫的流逝，毛病的数目不时累积，招致不受掌握的细胞发展，即肿瘤的产生。全基因组测序（WGS）是一项技巧，触及读取癌细胞的全部遗传配景，并将其与患者的安康细胞停止比拟，以检查DNA的渐变方法。经过研讨全部癌症基因组中存在的一切渐变并寻觅它们中的一切特点，有能够肯定影响肿瘤的各类身分。为了懂得WGS能否在临床情况中能够有效，剑桥研讨人员与瑞典同事协作展开了一项名为SCAN-B的全人群项目，该项目自2010年以来在瑞典南部招募一切被诊断出患有乳腺癌的妇女构成。因为SCAN-B具有年夜量临床成果数据，是以这一点至关主要。研讨人员应用WGS剖析了被诊断患有三阴性乳腺癌的患者的肿瘤样本遗传配景。这些癌症之所以被称为“三阴性”，是由于它们缺少的三个症结受体分子。“三阴性”乳腺癌约占一切类型乳腺癌的9％，而且随同着不良的预后的产生。在具有非洲和亚洲血缘的女性中，这品种型的乳腺癌也更为罕见。剑桥年夜学医学研讨理事会癌症部分的Serena Nik-Zainal博士说明说：“全部基因组测序使我们可以片面懂得癌症基因组。它提醒了很多我们以前看不到的器械。为每位患者供给完好的癌症基因组图谱有助于我们懂得是什么缘由招致了每位患者的肿瘤并更无效地医治每位个别。以前，这就像在航程中只要无限的地图，然则如今，经过全基因组测序，我们拥有一张更好，更具体的地图，而且晓得达到我们目标地的最佳道路。”然后，研讨人员使用了一种称为HRDetect的机械进修算法，他们先前曾经开辟出这种算法来辨认具有BRCA1或BRCA2基因渐变惹起特点的肿瘤。具有这两个基因之一的变领会年夜年夜添加个别患乳腺癌的风险。而且曾经开辟出PARP克制剂用于上述渐变激发的乳腺癌的医治。团队依据得分将每个患者分为高，中或低得分。得分高的患者是应用三阴性乳腺癌的以后医治办法后果最好的患者，他们也最有能够对PARP克制剂发生反响。令人诧异的是，那些得分中等的人成果最差。以后的三阴性乳腺癌医治后果无限，标明应对这些癌症须要新的办法。但是，经过WGS提醒的遗传变更和特点为驱动这些肿瘤的机制供给了线索，而这反过去能够有助于新药的开辟。第一作者，瑞典隆德年夜学临床迷信系的Johan Staaf博士说：“应用全基因组测序，我们可以在三阴性乳腺癌患者中真正地域分对以后药物能够有反响或无反响的患者亚群。主要的是，这种办法还为我们供给了一些线索，这些线索提醒了在预后成果差的肿瘤患者中失足的机制，是以我们可以若何对这些肿瘤停止分歧的医治或开辟新药。”测序技巧的成长一日千里，可以在24小时内停止WGS，别的24-48小时可以停止数据剖析。 是以，从实际上讲，应当为一切患者供给全基因组筛查，从而可以团体读出他们的肿瘤和潜在的医治选择。（生物谷100yiyao.com）
资讯出处：
原始出处： Nature Medicine (2019). DOI: 10.1038/s41591-019-0582-4 , https://nature.com/articles/s41591-019-0582-4

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