我国迷信家开辟新型miRNA |
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2019年10月8号,北京年夜学根底医学院周源团队和河北工业年夜学李建伟团队协作在Genome Biology上在线揭橥了题为Benchmark of computational methods for predicting microRNA-disease associations的文章。该研讨测试成果不只为生物医学研讨人员选择适合的-疾病联系关系猜测因子供给了参考,还为开辟更弱小的miRNA-疾病联系关系猜测因子供给了将来的偏向。
MicroRNA(miRNA)是22nt阁下的RNA,次要经过靶向mRNA的3‘UTR区来调理基因表达。这些小的普遍介入主要的生物学进程,例如细胞决裂,分化,凋亡,细胞周期调理,炎症和应激反响。是以,miRNA的掉调,包含表达掉调,功效取得或损失的渐变以及表不雅缄默,平日在很多疾病的发生发火和成长中起主要感化。
本研讨基于来自最新HMDDv3.1数据库的8000多种新鲜的miRNA疾病联系关系,对36种轻易取得的猜测办法停止了零碎比拟。经过严厉的准确召回曲线剖析对它们的全体功能停止了评价,个中有13种办法显示出可承受的精确性(AUPRC 0.200),而前两种办法的AUPRC则有愿望到达0.300以上。经过组合分歧的猜测变量或采取更新的miRNA类似度矩阵证实了功能进步的潜力,与最佳的单个猜测变量和应用先前类似性矩阵的猜测变量比拟,辨别可进步AUPRC的16%和46% 。
该基准测试成果不只为生物医学研讨人员选择适合的miRNA-疾病联系关系猜测因子供给了参考,还为开辟更弱小的miRNA-疾病联系关系猜测因子供给了将来的偏向。(100yiyao.com)
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