首个亚洲家猪“超清”基因组图谱宣布

近日，生物学预印本办事器（BioRxiv）在线揭橥了中国优秀处所猪——陆川猪的染色体级其余高质量定相（Phased）基因组序列。这不只弥补了亚洲家猪短少高质量参考基因组的空白，更为基因组组装供给了新的偏向。该项结果由中国农业迷信院深圳农业基因组研讨所（以下简称“基因组所”）猪基因组设计育种立异团队主导完成。

项目担任人、基因组所研讨员唐中林告知《中国迷信报》，应用多项测序技巧和组装算法，他们初次取得了染色体级别、完好的两套基因组序列。这标记着来自亲本的等位基因可以完好区分，为研讨等位基因的功效互作供给了名贵的数据和技巧根底，具有主要的实际和使用价值。

“包含人在内的好多物种，都是二倍体。也就是说，每一个二倍体个别中都有两套分歧亲原本源的单倍体序列。我们组装获得的猪基因组，除了有很高的持续性外，更是胜利地取得了2套染色体级其余基因组序列，这在基因组组装研讨范畴尚属初次。”唐中林说，“这意味着我们可以同时研讨同源染色体的变异，以及来自分歧亲本的等位基因功效。这是范畴迷信家们梦寐已久的，明天我们向前迈了一年夜步。”

据引见，器械方猪种拥有各自自力的驯化来源，分属两个分歧的退化分支，且具有分明的形状和学差别。但是，今朝猪基因组学研讨采取的是东方猪种杜洛克（Duroc）的基因组序列，这在必定水平下限制了对亚洲家猪的研讨。

退化研讨标明，陆川猪和杜洛克猪的分化工夫约为170万年前。项目介入方、深圳凌恩生物CEO牛永超引见，经过比拟二者基因组，他们发明陆川猪的272个阳性选择基因在卵白酪氨酸激酶活性、微管活动活性、GTPase激活物活性和泛素卵白转移酶活性等方面均明显富集，而杜洛克猪阳性选择基因与G卵白偶联受体活性亲密相干。这不只为猪学范畴供给了症结的基准数据，并且为应用猪做形式植物研讨人类安康和疾病开拓了一条新的路途。

唐中林引见，我国事世界上最年夜的生猪养殖和猪肉花费国，拥有全球1/3的猪种类。这些资本是深化发掘处所猪肉质和抗病力等主要性状优质基因的宝库。但是，跟着东方贸易猪种的普及，当地猪种遭到了十分年夜的冲击，有些有名处所种类的数目比年夜熊猫还要稀疏，部门种类甚至曾经灭尽。处所猪种质资本的维护刻不容缓，尤其在面临非洲猪瘟挑衅的明天，该基因组的宣布更是具有主要的计谋意义。

该研讨获得国度天然迷信基金重点项目、转基因严重专项、深圳市科创委和中国农业迷信院立异工程的支撑。(100yiyao.com）