Cell:新办法纯化出高纯度的细胞类型 |
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2019年10月6日讯/BIOON/---在一项新的研讨中,荷兰胡布勒支研讨所的Alexander van Oudenaarden及其团队开辟出一种称为GateID的办法,该办法可以在不应用抗体或申报基因的情况下从组织中纯化出感兴味的细胞类型。GateID许可迷信家们别离出多种细胞类型,比方,以便对它们停止更具体的研讨。相干研讨成果揭橥在2019年10月3日的Cell期刊上,论文题目为“Cell Type Purification by Single-Cell Transcriptome-Trained Sorting”。
图片来自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.08.006。
有很多分歧的细胞类型和亚型在体内履行分歧的义务。比方,是罕见的细胞亚型,关于器官的构成和保持至关主要。别的,由分歧的细胞类型构成,每种细胞类型对医治的反响能够分歧。总的来说,研讨单个细胞类型和亚型关于更好地懂得它们在安康和疾病中的特征和功效很主要。
迄今为止,基于存在于细胞表面面的特定标记物来纯化属于特定细胞类型的单个细胞(比方)。为了停止这种纯化,人们应用可以联合这些标记物的荧光抗体或培养出对感兴味的细胞停止荧光标志的基因改革生物。在这两种情形下,这些收回荧光的细胞都可以经过流式细胞仪加以检测和特异性纯化。虽然这些办法功效弱小,然则它们并非老是可用。比方,在人体中弗成能停止基因润饰,抗体可用性并非老是获得确保。是以,因为缺少纯化处理计划,某些细胞类型依然是无法取得的。
GateID
这些研讨人员开辟了一种新对象GateID,该对象可以仅依据细胞的自然特点(比方外形,年夜小和粒度)纯化细胞类型,这些自然特点可以经过流式细胞仪停止测量。这种新办法可以纯化感兴味的细胞类型,而不用选择基因改革生物或市场上发卖的抗体。
来自细胞外部和内部的GateID信息。起首,研讨人员经过从所选择的器官或组织中搜集单个细胞来发生数据集。关于每个细胞,对这些细胞的自然特点(它们从里面看起来的样子)和它们的特定基因表达谱(它们在外部的特点)都停止测量。然后,这些研讨人员经过它们的基因表达谱来判定每个细胞所属的细胞类型。接着,他们将这些自然特点与判定出的细胞类型相偶联在一路。接上去,GateID可以选择最佳的自然特点,以在很多后续试验中纯化所需的细胞类型。他们发明GateID可以将几种细胞类型别离到较高的纯度。
纯化血液和胰腺细胞类型
在这项新的研讨中,这些研讨人员应用GateID从斑马鱼的免疫零碎中纯化出四种细胞类型,包含造血干细胞和祖细胞,以及从人胰腺中纯化出α细胞和β细胞。在将来,迷信家们将可以应用GateID来纯化和研讨任何感兴味的细胞类型,比方和细胞。(100医药网 100yiyao.com)
参考材料:
1.Chloé S. Baron et al. . Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.08.006.
2.New method to purify cell types to high purity
https://phys.org/news/2019-10-method-purify-cell-high-purity.html
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